Proti predlogu je glasovalo 71 poslancev, za je bilo 41 poslancev, trije pa so se vzdržali. Sabor je ob tem izglasoval dodatne predloge Hrvaške kmečke stranke. Ta je predlagala, da Hrvaško pri uresničevanju sporazuma o JEK-u ne obvezujejo določila slovenskega zakona o ratifikaciji, ki se nanašajo na roke skladiščenja radioaktivnih odpadkov. Sabor je vlado tudi zadolžil, da od Slovenije zahteva dosledno izvajanje sporazuma in hkrati povračilo stroškov zaradi neizpolnjevanja sprejetega sporazuma po 30. 6. 2002.