Na posnetkih so vidni velikanski izbruhi vulkanov na površju Jupitrove lune Io in rdečih neviht v Jupitrovi atmosferi. New Horizon je naredil tudi nove posnetke Europe, Ganymede in Calliste, drugih največjih Jupitrovih lun.

Sonda je bila ob preletu od Jupitra oddaljena 2,3 milijona kilometrov, da bi s tem pridobila hitrost, ki jo potrebuje na poti proti svojemu končnemu cilju, Plutonu.

Prelet je omogočil tudi zelo dober ogled Majhne rdeče pege, nevihte, velike kot Zemlja, ki divja v Jupitrovi atmosferi. Oblikovala se je z združitvijo treh manjših neviht med letoma 1998 in 2000. Njen "veliki brat", velikanski orkan, znan kot Velika rdeča pega, na Jupitru obstaja že stoletja.