Agencija je tako usposobljena za upravljanje s sredstvi Evropskega kmetijskega usmerjevalnega in jamstvenega sklada, ima pa tudi varno in zanesljivo tehnično podporo ter vzpostavljene nadzorne mehanizme.

Iz omenjenega sklada se financirajo vsi ukrepi prvega stebra skupne kmetijske politike EU-ja, to so neposredna plačila, ukrepi zunanje trgovine ter intervencijski in specifični ukrepi, financirajo pa se tudi ukrepi programa razvoja podeželja 2004-2006 iz drugega stebra.

Izplačila letošnjih subvencij, v okviru katerih bo agencija kmetom razdelila več kot 40 milijard tolarjev, se bodo predvidoma začela po 15. novembru.