Za vrnitev pooblastil so se odločili zaradi "številnih poskusov diskreditacije dela zbornice in postopkov, ki se zoper zbornico sprožajo, čeprav je odločitev o podelitvi javnih pooblastil zbornici pravnomočno potrdilo tudi upravno sodišče". Večina postopkov je po navedbah zbornice posledica pritožb Društva fizioterapevtov Slovenije. Ministrstvu bodo vrnili tudi vsa javna sredstva, ki so jih dobili na podlagi pogodbe.

Zapleti že od razpisa leta 2005
Zbornica je leta 2005 kandidirala na javnem razpisu za dodelitev javnega pooblastila za oddajo nalog s področja fizioterapije. Ugotovljeno je bilo, da izpolnjuje pogoje, to je, da je včlanjenih 60 odstotkov vseh zdravstvenih delavcev, ki izvajajo naloge s področja fizioterapije. Prijava društva fizioterapevtov je bila na razpisu zavrnjena. Društvo se je na razpis pritožilo, tako da je takratni minister za zdravje Andrej Bručan izdajo pooblastila zadržal. Nato se je zaradi nerealizacije pooblastila pritožila še zbornica. Upravno sodišče, ki je odločalo o obeh pritožbah, je ugodilo pritožbi zbornice.

Informacijska pooblaščenka pa je letos ugotovila, da je zbornica nezakonito obdelovala osebne podatke posameznikov in v zvezi s tem kazensko ovadila zdajšnjega ministra za zdravje Boruta Miklavčiča, nekdanjega ministra Bručana in predsednico fizioterapevtske zbornice Frideriko Kresal. Med člane fizioterapevtske zbornice naj bi navedli tudi fizioterapevte, ki v to niso nikoli privolili. Komisija za preprečevanje korupcije je ugotovila, da prikazovanje neobstoječega članstva za pridobitev javnih pooblastil ustreza definiciji korupcije. Domnevne nepravilnosti je obravnavala tudi policija, upravno sodišče pa je odločbo informacijske pooblaščenke zadržalo.