Nadzornik, zadolžen za varstvo podatkov, pravi, da bi bilo potrebno ohraniti tudi druge načine preverjanja identitete. Poleg tega se pri izmenjavi prstnih odtisov in DNK-ja med državami pod vprašaj postavlja tudi varstvo osebnih podatkov, zato Hustinx opozarja, da je treba ob vse večji krepitvi izmenjave podatkov posebno pozornost nameniti varovanju zasebnosti.

Države EU-ja so se lani po vztrajnih zahtevah ZDA-ja odločile, da bodo v potne liste, vizume in dovoljenja za bivanje vključile biometrične podatke. Obenem je Bruselj sprejel vrsto ukrepov, katerih namen je izboljšanje dostopnosti do evropskih podatkovnih baz.

Ob tem študija Evropske komisije iz leta 2005 kaže, da bodo biometrični podatki do leta 2015 postali del našega vsakdana, uporabljali pa naj bi jih tako v zasebnem kot v poslovnem življenju. Biometrično osnovani sistemi naj bi omejevali vstop v pisarno ali omogočali elektronsko plačevanje in nakupovanje prek spleta.