Omota je kot tonski mojster sodeloval pri prvem slovenskem zvočnem celovečernem filmu Na svoji zemlji, med njegovimi filmskimi in tonskimi posnetki pa je tudi legendarna Kukavica. Med drugim je sestavil prvo zvočno kamero, postavil prvo piratsko radijsko postajo in prvi slovenski zvočni kino ter izumil magnetoskopsko mešalno mizo.

Skrivno snemanje
Veliko dokumentarno vrednost ima tudi posnetek znamenitega koncerta Akademskega pevskega zbora pod vodstvom Franceta Marolta med okupacijo decembra 1941 v ljubljanski unionski dvorani, ki ga je Omota posnel na tonsko sled filmskega traku, z mikrofonom, skritim v lestencu nad odrom. Jenkova Lipa zelenela je je prav na tem koncertu postala izraz in dokaz domoljubja ter narodne in borbene zavesti.

Priznanja in nagrade
Omota je za svoje delo prejel mnogo priznanj in nagrad; leta 1998 je prejel najvišjo strokovno nagrado za delo na področju filma, nagrado Metod Badjura za življenjsko delo, ki jo podeljuje Društvo slovenskih filmskih ustvarjalcev. Leta 2004 je od tedanjega predsednika države Janeza Drnovška prejel državno odlikovanje zlati red za zasluge za življenjsko delo in prispevek k slovenski kulturi. Režiser Dražen Štader pa se mu je leta 2005 poklonil z dokumentarnim filmom Rudi Omota - prezrto poglavje slovenske kinematografije.